医患纠纷第三方调解有以下司法程序：
1、人民法院根据当事人自愿的原则进行调解；
2、可以由审判员一人主持，也可以由合议庭主持；
3、当事人调解达成协议的，调解协议的内容不得违反法律规定。
《中华人民共和国民事诉讼法》第九十三条
人民法院审理民事案件，根据当事人自愿的原则，在事实清楚的基础上，分清是非，进行调解。
第九十四条
人民法院进行调解，可以由审判员一人主持，也可以由合议庭主持，并尽可能就地进行。人民法院进行调解，可以用简便方式通知当事人、证人到庭。
第九十五条
人民法院进行调解，可以邀请有关单位和个人协助。被邀请的单位和个人，应当协助人民法院进行调解。
第九十六条
调解达成协议，必须双方自愿，不得强迫。调解协议的内容不得违反法律规定。
